動物細胞大規模培養的生物反應器操作模式，一般分為分批式操作（batch）、流加式操作（Fed-batch）、半連續式操作（semi-continuous）、連續式操作（continuous）和灌流式操作（perfusion）五種操作模式。 

1. 批式操作（batch culture） 
    批式操作是動物細胞規模培養進程中較早期采用的方式，也是其它操作方式的基礎。該方式采用機械攪拌式生物反應器，將細胞擴大培養后，一次性轉入生物反應器內進行培養，在培養過程中其體積不變，不添加其它成分，待細胞增長和產物形成積累到適當的時間，一次性收獲細胞、產物、培養基的操作方式。 
    該方式的特點:(1) 操作簡單。培養周期短，染菌和細胞突變的風險小。反應器系統屬于封閉式，培養過程中與外部環境沒有物料交換，除了控制溫度、pH值和通氣外，不進行其他任何控制，因此操作簡單，容易掌握；(2)直觀的反應細胞生長代謝的過程。 由于培養期間細胞的生長代謝是在一個相對固定的營養環境，不添加任何營養成分,因此可直觀的反應細胞生長代謝的過程,是動物細胞工藝基礎條件或"小試"研究常用的手段；(3)可直接放大。由于培養過程工藝簡單，對設備和控制的要求較低，設備的通用性強，反應器參數的放大原理和過程控制，比較其它培養系統較易理解和掌握，在工業化生產中分批式操作是傳統的、常用的方法，其工業反應器(Genetech)規模可達12000L。
    分批培養過程中，細胞的生長分為五個階段：延滯期、對數生長期、減速期、平穩期和衰退期。分批培養的周期時間多在3~5天，細胞生長動力學表現為細胞先經歷對數生長期（48~72h）細胞密度達到最高值后，由于營養物質耗劫或代謝毒副產物的累積細胞生長進入衰退期進而死亡，表現出典型的生長周期。收獲產物通常是在細胞快要死亡前或已經死亡后進行。 
    經過改進的攪拌式生物反應器，目前仍是大規模培養動物細胞用以生產各種藥物的主要設備，也是早期用以生產單抗的主要途徑。在用攪拌式生物反應器分批式培養單抗中，最多采用的是微囊或巨載體培養。與一般的懸浮培養比較，雜交瘤細胞依托微囊化或巨載體后，相對固定化，降低了攪拌培養時對細胞的剪切力，提高了細胞的密度和穩定性及生產率。在1986年以前，采用此種方式培養的雜交瘤細胞就有100多種。

2. 流加式操作（fed-batch culture） 
    流加式操作是在批式操作的基礎上，采用機械攪拌式生物反應器系統，懸浮培養細胞或以懸浮微載體培養貼壁細胞，細胞初始接種的培養基體積一般為終體積的1/2 ～1/3，在培養過程中根據細胞對營養物質的不斷消耗和需求，流加濃縮的營養物或培養基，從而使細胞持續生長至較高的密度，目標產品達到較高的水平，整個培養過程沒有流出或回收，通常在細胞進入衰亡期或衰亡期后進行終止回收整個反應體系，分離細胞和細胞碎片，濃縮、純化目標蛋白。
流加培養主要有以下特點：
1） 流加培養根據細胞生長速率、營養物消耗和代謝產物抑制情況，流加濃縮的營養培養基，流加的速率通常與消耗的速率相同，根據測得的底物濃度控制相應的流加過程，以保證合理的培養環境與較低的代謝產物抑制水平。
2） 培養過程以低稀釋率流加，細胞在培養系統中停留時間較長，總細胞密度較高，產物濃度較高。
3） 流加培養過程須掌握細胞生長動力學，能量代謝動力學，研究細胞環境變化時的瞬間行為。流加培養細胞培養基的設計和培養條件與環境優化，是整個培養工藝中的主要內容。
4） 在工業化生產，懸浮流加培養工藝參數的放大原理和過程控制，比較其它培養系統較易理解和掌握，可采用工藝參數的直接放大。
    流加培養工藝是當前動物細胞培養工藝中占有主流優勢的培養工藝，也是近年來動物細胞大規模培養研究的熱點。流加培養工藝中的關鍵技術是基礎培養基和流加濃縮的營養培養基。通常進行流加的時間多在指數生長后期，細胞在進入衰退期之前，添加高濃度的營養物質。可以添加一次，也可添加多次，為了追求更高的細胞密度往往需要添加一次以上，直至細胞密度不再提高；可進行脈沖式添加，也可以降低的速率緩慢進行添加，但為了盡可能的維持相對穩定的營養物質環境，后者采用較多；添加的成分比較多，凡是促細胞生長的物質均可以進行添加。流加的總體原則是維持細胞生長相對穩定的培養環境，營養成分即不過剩而產生大量的代謝副產物造成營養利用效率下降而成為無效的利用；也不缺乏導致細胞生長抑制或死亡。
流加工藝中的營養成分主要分為三大類：
1） 葡萄糖。葡萄糖是細胞的供能物質和主要的碳源物質，然而當其濃度較高是會產生大量的代謝產物乳酸，因而需要進行其濃度控制，以足夠維持細胞生長而不至于產生大量的副產物的濃度為佳；
2） 谷氨酰胺。谷氨酰胺是細胞的供能物質和主要的氮源物質，然而當其濃度較高是會產生大量的代謝產物氨，因而也需要進行其濃度控制，以足夠維持細胞生長而不至于產生大量的副產物的濃度為佳；
3） 氨基酸、維生素及其他。主要包括營養必需氨基酸、營養非必需氨基酸、一些特殊的氨基酸如羥脯氨酸、羧基谷氨酸和磷酸絲氨酸；此外還包括其他營養成分如膽堿、生長刺激因子。添加的氨基酸形式多為左旋氨基酸，因而多以鹽或前體的形式替代單分子氨基酸，或者添加四肽或短肽的形式。在進行添加時，不溶性氨基酸如胱氨酸、酪氨酸和色氨酸只在中性pH值部分溶解，可采用泥漿的形式進行脈沖式添加；其他的可溶性氨基酸以溶液的形式用蠕動泵進行緩慢連續流加。
流加式操作分為兩種類型：單一補料分批式操作和反復補料分批式操作。
1） 單一補料分批式操作是在培養開始時投入一定量的基礎培養液，培養到一定時期，開始連續補加濃縮營養物質，直到培養液體積達到生物反應器的最大操作容積，停止補加，最后將細胞培養液一次全部放出。該操作方式受到反應器操作容積的限制，培養周期只能控制在較短的時間內。
2） 反復補料分批式操作是在單一補料分批式操作的基礎上，每個一定時間按一定比例放出一部分培養液，是培養液體積始終不超過反應器的最大操作容積，從而在理論上可以延長培養周期，直至培養效率下降，才將培養液全部放出。

3.半連續式操作（semi-continuous culture）、重復批式操作（repeated batch culture）、換液操作（medium change culture） 半連續式操作又稱為重復分批式操作或換液操作。采用機械攪拌式生物反應器系統，懸浮培養形式。在細胞增長和產物形成過程中，每間隔一段時間，從中取出部分培養物，再用新的培養液補足到原有體積，使反應器內的總體積不變。
    這種類型的操作是將細胞接種一定體積的培養基，讓其生長至一定的密度，在細胞生長至最大密度之前，用新鮮的培養基稀釋培養物，每次稀釋反應器培養體積的1/2~3/4，以維持細胞的指數生長狀態，隨著稀釋率的增加培養體積逐步增加。或者在細胞增長和產物形成過程中，每隔一定時間，定期取出部分培養物，或是條件培養基，或是連同細胞、載體一起取出，然后補加細胞或載體，或是新鮮的培養基繼續進行培養的一種操作模式。剩余的培養物可作為種子，繼續培養，從而可維持反復培養，而無需反應器的清洗、消毒等一系列復雜的操作。在半連續式操作中由于細胞適應了生物反應器的培養環境和相當高的接種量，經過幾次的稀釋、換液培養過程，細胞密度常常會提高。 
    半連續式操作的特點為：1）培養物的體積逐步增加；2）可進行多次收獲；3）細胞可持續指數生長，并可保持產物和細胞在一較高的濃度水平，培養過程可延續到很長時間。
該操作方式的優點是操作簡便，生產效率高，可長時期進行生產，反復收獲產品，可使細胞密度和產品產量一直保持在較高的水平。在動物細胞培養和藥品生產中被廣泛應用。

4. 連續式操作（continuous culture） 
    連續式操作是一種常見的懸浮培養模式，采用機械攪拌式生物反應器系統。該模式是將細胞接種與一定體積的培養基后，為了防止衰退期的出現，在細胞達最大密度之前，以一定速度向生物反應器連續添加新鮮培養基；與此同時，含有細胞的培養物以相同的速度連續從反應器流出，以保持培養體積的恒定。理論上講，該過程可無限延續下去。連續培養的最大優點是反應器的培養狀態可以達到恒定，細胞在穩定狀態下生長。穩定狀態可有效的延長分批培養中的對數生長期。在穩定狀態下細胞所處的環境條件如營養物質濃度、產物濃度、pH值可保持恒定，細胞濃度以及細胞比生長速率可維持不變。細胞很少受到培養環境變化帶來的生理影響，特別是生物反應器的主要營養物質葡萄糖和谷氨酰胺，維持在一個較低的水平，從而使他們的利用效率提高，有害產物積累有所減少。然而在高的稀釋率下，雖然死細胞和細胞碎片及時清除，細胞活性高最終細胞密度得到提高；可是產物卻不斷在稀釋，因而產物濃度并為提高；尤其是細胞和產物不斷的稀釋，營養物質利用率、細胞增長速率和產物生產速率低下。此外，連續式操作還有一些不足，如：1）由于是開放式操作，加上培養周期較長，容易造成污染；2）在長周期的連續培養中，細胞的生長特性以及分泌產物容易變異；3）對設備、儀器的控制技術要求較高。
    連續式操作使用的反應器多數是攪拌式生物反應器，也可以是管式反應器。
   連續式操作的特點為：1）細胞維持持續指數增長；2）產物體積不斷增長；3）可控制衰退期與下降期。

5. 灌流式操作（perfusion culture） 
    灌流式操作是把細胞和培養基一起加入反應器后，在細胞增長和產物形成過程中，不斷地將部分條件培養基取出，同時又連續不斷地灌注新的培養基。它與半連續式操作的不同之處在于取出部分條件培養基時，絕大部分細胞均保留在反應器內，而半連續培養在取培養物時同時也取出了部分細胞。
    灌流式操作常使用的生物反應器主要有兩種形式。一種是用攪拌式生物反應器懸浮培養細胞，這種反應器必須具有細胞截流裝置，細胞截留系統開始多采用微孔膜過濾或旋轉膜系統，最近開發的有各種形式的沉降系統或透析系統。
    中空纖維生物反應器是連續灌流操作常用的一種。它采用的中空纖維半透膜，透過小分子量的產物和底物，截流細胞和分子量較大的產物，在連續灌流過程中將絕大部分細胞截留在反應器內；近年來中空纖維生物反應器被廣泛應用于產物分泌性動物細胞的生產，主要用于培養雜交瘤細胞生產單克隆抗體。
    另外一種形式是固定床或流化床生物反應器，固定床是在反應器中裝配固定的籃筐，中間裝填聚脂纖維載體，細胞可附著在載體上生長，也可固定在載體纖維之間，靠上攪拌中產生的負壓，迫使培養基不斷流經填料，有利于營養成分和氧的傳遞，這種形式的灌流速度較大，細胞在載體中高密度生長。流化床生物反應器是通過流體的上升運動使固體顆粒維持在懸浮狀態進行反應，適合于固定化細胞的培養。
    灌流式操作的共同優點是：①細胞截流系統可使細胞或酶保留在反應器內，維持較高的細胞密度，一般可達107-109/ml，從而較大的提高了產品的產量；②連續灌流系統，使細胞穩定的處在較好的的營養環境中，有害代謝廢物濃度積累較低；③反應速率容易控制，培養周期較長，可提高生產率，目標產品回收率高；④產品在罐內停留時間短，可及時回收到低溫下保存，有利于保持產品的活性。連續灌注培養法是近年來用于哺乳動物細胞培養生產分泌型重組治療性藥物和嵌合抗體，以及人源化抗體等基因工程抗體較為推崇的一種操作方式。應用連續灌流工藝的公司有Genzyme, Genetic Institute, Bayer公司等